Магистрантка НГУ составила список из 328 генов для раннего Паркинсона
Исследование касается болезни Паркинсона, которая начинается до 50 лет. Гены-кандидаты уже отобраны, а проверка отобранных вариантов на нейронах пациентов пока продолжается.
Магистрантка Факультета естественных наук НГУ Алена Сафонова выявила генетические варианты, которые потенциально связаны с ранним началом болезни Паркинсона. Работа выполнена под научным руководством Анастасии Малаховой из лаборатории эпигенетики развития ИЦиГ СО РАН в рамках проекта института при поддержке гранта Фонда научно-технологического развития Югры. Главный итог первой части — список из 328 генов-кандидатов, варианты в которых могут приводить к болезни.
Болезнь Паркинсона — хроническое заболевание мозга: в черной субстанции гибнут нейроны, вырабатывающие дофамин. Это наиболее частое нейродегенеративное заболевание после болезни Альцгеймера. Обычно первые симптомы появляются в 55–60 лет, но в ряде случаев болезнь начинается до 40 лет, а ювенильная форма — до 20. Полностью вылечить её пока нельзя, терапия помогает контролировать симптомы. Причина в большинстве случаев не выяснена, а наследственные мутации генов связаны примерно с 5–10% случаев.
Для поиска авторы взяли данные экзомного секвенирования 35 пациентов Федерального центра нейрохирургии в Новосибирске моложе 50 лет с ранним началом болезни. Анализ провели в программе Genomenal. Отобрали более 5 тысяч генов с редкими вариантами, затем из 357 путей и биологических процессов выбрали 13, связанных с развитием болезни. 836 генов из этих путей ранжировали по функциональному сходству с уже известными генами паркинсонизма.
Почти всегда они возникают внезапно и, казалось бы, беспричинно. До сих пор не удается полностью объяснить причины, которые могли бы вызывать это заболевание в раннем возрасте.
Во второй части работы отобранные варианты проверяют на дофаминергических нейронах. Из клеток крови пациентов получают индуцированные плюрипотентные стволовые клетки (ИПСК), которые возвращают в плюрипотентное состояние с помощью генетического репрограммирования. Дифференцировка в нейроны занимает 2 месяца, не считая получения стволовых клеток, и эффективность не всегда соответствует ожиданиям. Нейрональные клетки пациентов уже получены, а оценку их метаболизма исследователи planируют начать в ближайшее время.
Исследователи сосредоточились на митохондриях — органеллах, которые вырабатывают основную часть энергии клетки. По их гипотезе, у пациентов с неизвестной причиной болезни может быть не одно нарушение, а несколько слабых, которые вместе приводят к заболеванию. Рассчитывая выявить новые варианты, ранее не связанные с болезнью Паркинсона, ученые считают, что оценка патологических процессов в нейронах поможет уточнить вклад найденных вариантов и расширит возможности ранней диагностики.
Комментарии
Пока никто не написал. Будьте первым.