Ученые представили крупнейший атлас транскриптомики крови WBT Atlas

Международный коллектив исследователей создал WBT Atlas — масштабную базу данных транскриптомики цельной крови, объединившую более 4,4 тысячи образцов по 98 состояниям здоровья.

В работе, опубликованной в журнале Nature Communications, специалисты объединили 4 444 образца крови. Для части участников исследователи сопоставили данные транскриптомики и протеомики плазмы, что позволило изучить молекулярные особенности болезней на уровне генов и белков.

Анализ показал, что вариабельность экспрессии генов в крови сильнее зависит от состояния здоровья, чем от возраста или пола пациента. Авторы выделили группу из 32 генов, связанных со старением, на основе которой создали модель для оценки биологического возраста. Наибольшие изменения активности генов зафиксировали при сепсисе, хронической обструктивной болезни легких, анкилозирующем спондилите и анафилаксии.

Интеграция РНК и белковых данных повысила точность диагностики и помогла выявить РНК-белковые модули, связанные с типами иммунных клеток. Полученные сигнатуры прошли проверку на независимых выборках, включая данные британского биобанка UK Biobank. Созданный ресурс опубликован на платформе PhenomeAtlas для использования в точных медицинских исследованиях.

Источник: Vademecum